CircRNA整体研究方案

相关知识：

环状RNA（circular RNA，circRNA）是最近发现的一类特殊的非编码RNA，它大量存在于真核细胞胞质内，主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生。近年研究发现，circRNA具有很多重要的调控功能，例如，circRNA可以作为竞争性内源RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）结合胞内miRNA，阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。除此以外，circRNA也具有调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等功能。circRNA在不同物种中具有保守性，而且存在组织表达差异，且circRNA的环状结构对RNase不敏感，导致它比线性RNA更为稳定，这些特性使得circRNA具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力，研究意义重大。

服务内容：

1）环状RNA生物信息学预测

2) 环状RNA高通量测序

3）环状RNA表达丰度检测

4）FISH 检测环状RNA的亚细胞定位

5）NorthernBlot 检测环化RNA的存在

6）环状RNA的过表达实验（Gain of function）

7）环状RNA功能缺失实验（Loss of function ）

8）环状RNA与miRNA互作结合生物预测及实验验证

9）环状RNA与miRNA相互作用预测研究

10）环状RNA与蛋白相互作用研究

circRNA的形成（A）以及作用机制（B）

重要意义：

在对circRNA 结构和功能研究的基础上，有研究人员发现它们在动脉粥样硬化，神经系统紊乱，糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中，发挥非常重要的作用。对环状RNA研究具有重要的意义：

1）circRNA独具的竞争性内源（ceRNA）特征可为药物开发提供新的思路；

2）circRNA的组织特异性和稳定性有可能使circRNA成为一种良好的生物标志物；

3）circRNA 的研究为生命的进化研究提供新的方向。

circRNA相关数据库：

circBase: http://www.circbase.org/

circNET: http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/

StarBase V2: http://deepbase.sysu.edu.cn/

CircInteractome: http://circinteractome.nia.nih.gov/

Circ2Traits: http://gyanxet-beta.com/circdb/

CSCD: http://gb.whu.edu.cn/CSCD

exoRBase: http://www.exoRBase.org